
library(testthat)

source("user_code.R")
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("data directory contains sample data CSV", {
  expect_true(file.exists("data/sample_data.csv"),
    info = "sample_data.csv should exist in data directory")
})

test_that("results directory contains analysis results CSV", {
  expect_true(file.exists("results/analysis_results.csv"),
    info = "analysis_results.csv should exist in results directory")
})

test_that("scripts directory contains R analysis script", {
  expect_true(file.exists("scripts/analysis_script.R"),
    info = "analysis_script.R should exist in scripts directory")
})

test_that("main directory contains README file", {
  expect_true(file.exists("README.txt"),
    info = "README.txt should exist in main directory")
})

test_that("project_files includes all created directories and files", {
  out_user_code <- capture.output(source("user_code.R"))
  expect_true(any(grepl("data/sample_data.csv", out_user_code)),
    info = "data/sample_data.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("results/analysis_results.csv", out_user_code)),
    info = "results/analysis_results.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("scripts/analysis_script.R", out_user_code)),
    info = "scripts/analysis_script.R should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("README.txt", out_user_code)),
    info = "README.txt should be listed in project_files")
})

test_main.R

En praktisk introduktion til R-programmering tilpasset biologer og bioinformatikere. Lær at analysere, visualisere og fortolke biologiske data ved hjælp af R med virkelighedsnære eksempler fra genomik, økologi og eksperimentel biologi.

Lær det grundlæggende i R-programmering med fokus på biologiske data, herunder variabler, datatyper og grundlæggende datamanipulation.

Dyk ned i statistiske metoder til analyse af biologiske data, herunder beskrivende statistik, hypoteseprøvning og fortolkning af resultater.

Behersk kunsten at visualisere biologiske data ved hjælp af R, fra grundlæggende diagrammer til mere avancerede visualiseringer relevante for eksperimenter.

Lær at arbejde med genomiske data og udvikle reproducerbare arbejdsgange til videnskabelig forskning i R.

Challenge: Sharing and Collaboration

Løsning