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Lernen Challenge: Sharing and Collaboration | Reproducible and Genomic-Style Analysis
R für Biologen und Bioinformatik
Abschnitt 4. Kapitel 6
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Challenge: Sharing and Collaboration

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Aufgabe

Wischen, um mit dem Codieren zu beginnen

Organisation eines R-Projekts, Export von Analyseergebnissen und Vorbereitung von Dateien für die Zusammenarbeit mit Kolleginnen und Kollegen.

  • Anlegen von Verzeichnissen für Daten, Ergebnisse, Skripte und Abbildungen.
  • Speichern eines Beispieldatenrahmens als CSV-Datei im Datenverzeichnis.
  • Durchführung einer einfachen Analyse der Daten und Speichern der Ergebnisse als CSV-Datei im Ergebnisverzeichnis.
  • Speichern eines R-Skripts im Skriptverzeichnis, das die Analyse reproduziert.
  • Erstellen einer README-Datei im Hauptverzeichnis des Projekts, die das Projekt und dessen Struktur beschreibt.
  • Auflisten aller Dateien im Projekt, um zu bestätigen, dass sie für die Weitergabe bereit sind.

Lösung

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Wie können wir es verbessern?

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