
library(testthat)

source("user_code.R")
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("data directory contains sample data CSV", {
  expect_true(file.exists("data/sample_data.csv"),
    info = "sample_data.csv should exist in data directory")
})

test_that("results directory contains analysis results CSV", {
  expect_true(file.exists("results/analysis_results.csv"),
    info = "analysis_results.csv should exist in results directory")
})

test_that("scripts directory contains R analysis script", {
  expect_true(file.exists("scripts/analysis_script.R"),
    info = "analysis_script.R should exist in scripts directory")
})

test_that("main directory contains README file", {
  expect_true(file.exists("README.txt"),
    info = "README.txt should exist in main directory")
})

test_that("project_files includes all created directories and files", {
  out_user_code <- capture.output(source("user_code.R"))
  expect_true(any(grepl("data/sample_data.csv", out_user_code)),
    info = "data/sample_data.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("results/analysis_results.csv", out_user_code)),
    info = "results/analysis_results.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("scripts/analysis_script.R", out_user_code)),
    info = "scripts/analysis_script.R should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("README.txt", out_user_code)),
    info = "README.txt should be listed in project_files")
})

test_main.R

Käytännönläheinen johdatus R-ohjelmointiin, joka on suunnattu biologeille ja bioinformaatikoille. Opettele analysoimaan, visualisoimaan ja tulkitsemaan biologista dataa R:n avulla, käyttäen esimerkkejä genomiikasta, ekologiasta ja kokeellisesta biologiasta.

Opi R-ohjelmoinnin perusteet keskittyen biologiseen dataan, mukaan lukien muuttujat, tietotyypit ja perusdatan käsittely.

Syvenny tilastollisiin menetelmiin biologisten aineistojen analysoinnissa, mukaan lukien yhteenvetotilastot, hypoteesien testaus ja tulosten tulkinta.

Hallitse biologisten tietojen visualisoinnin taito R:llä, peruskaavioista edistyneempiin kokeisiin liittyviin visualisointeihin.

Opettele käsittelemään genomityyppistä dataa ja kehittämään toistettavia työnkulkuja tieteelliseen tutkimukseen R:ssä.

Challenge: Sharing and Collaboration

Ratkaisu