
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("df1 has correct structure and at least 5 rows", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df1"), info = "df1 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df1), info = "df1 must be a data frame.")
  expect_true(all(c("SampleID", "Treatment", "Outcome") %in% colnames(df1)), info = "df1 must have columns 'SampleID', 'Treatment', and 'Outcome'.")
  expect_true(nrow(df1) >= 5, info = "df1 must have at least five rows.")
})

test_that("df2 filters only DrugA treatments", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df2"), info = "df2 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df2), info = "df2 must be a data frame.")
  expect_true(all(df2$Treatment == "DrugA"), info = "All rows in df2 must have Treatment as 'DrugA'.")
})

test_that("df3 filters only Alive outcomes", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df3"), info = "df3 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df3), info = "df3 must be a data frame.")
  expect_true(all(df3$Outcome == "Alive"), info = "All rows in df3 must have Outcome as 'Alive'.")
})

test_that("function does not require user input", {
  expect_error(organize_experiment_data(), NA, info = "The function should not require user input and should run without errors.")
})

test_main.R

Käytännönläheinen johdatus R-ohjelmointiin, joka on suunnattu biologeille ja bioinformaatikoille. Opettele analysoimaan, visualisoimaan ja tulkitsemaan biologista dataa R:n avulla, käyttäen esimerkkejä genomiikasta, ekologiasta ja kokeellisesta biologiasta.

Opi R-ohjelmoinnin perusteet keskittyen biologiseen dataan, mukaan lukien muuttujat, tietotyypit ja perusdatan käsittely.

Syvenny tilastollisiin menetelmiin biologisten aineistojen analysoinnissa, mukaan lukien yhteenvetotilastot, hypoteesien testaus ja tulosten tulkinta.

Hallitse biologisten tietojen visualisoinnin taito R:llä, peruskaavioista edistyneempiin kokeisiin liittyviin visualisointeihin.

Opettele käsittelemään genomityyppistä dataa ja kehittämään toistettavia työnkulkuja tieteelliseen tutkimukseen R:ssä.

Challenge: Kokeellisten Tietojen Järjestäminen

Ratkaisu