
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("geneA_sample1 is 5.2", {
  expect_true(exists("geneA_sample1"), info = "geneA_sample1 does not exist.")
  expect_equal(geneA_sample1, 5.2, tolerance = 1e-8, info = "geneA_sample1 is not equal to 5.2.")
})

test_that("geneA_sample2 is 6.8", {
  expect_true(exists("geneA_sample2"), info = "geneA_sample2 does not exist.")
  expect_equal(geneA_sample2, 6.8, tolerance = 1e-8, info = "geneA_sample2 is not equal to 6.8.")
})

test_that("geneA_sample3 is 7.1", {
  expect_true(exists("geneA_sample3"), info = "geneA_sample3 does not exist.")
  expect_equal(geneA_sample3, 7.1, tolerance = 1e-8, info = "geneA_sample3 is not equal to 7.1.")
})

test_that("geneA_expression vector is correct", {
  expect_true(exists("geneA_expression"), info = "geneA_expression does not exist.")
  expect_true(is.numeric(geneA_expression), info = "geneA_expression is not numeric.")
  expect_equal(length(geneA_expression), 3, info = "geneA_expression does not have length 3.")
  expect_equal(geneA_expression, c(5.2, 6.8, 7.1), tolerance = 1e-8, info = "geneA_expression does not contain the correct values in the correct order.")
})

test_that("geneA_mean is correct", {
  expect_true(exists("geneA_mean"), info = "geneA_mean does not exist.")
  expect_equal(geneA_mean, mean(c(5.2, 6.8, 7.1)), tolerance = 1e-8, info = "geneA_mean does not contain the correct mean value.")
})

test_main.R

Käytännönläheinen johdatus R-ohjelmointiin, joka on suunnattu biologeille ja bioinformaatikoille. Opettele analysoimaan, visualisoimaan ja tulkitsemaan biologista dataa R:n avulla, käyttäen esimerkkejä genomiikasta, ekologiasta ja kokeellisesta biologiasta.

Opi R-ohjelmoinnin perusteet keskittyen biologiseen dataan, mukaan lukien muuttujat, tietotyypit ja perusdatan käsittely.

Syvenny tilastollisiin menetelmiin biologisten aineistojen analysoinnissa, mukaan lukien yhteenvetotilastot, hypoteesien testaus ja tulosten tulkinta.

Hallitse biologisten tietojen visualisoinnin taito R:llä, peruskaavioista edistyneempiin kokeisiin liittyviin visualisointeihin.

Opettele käsittelemään genomityyppistä dataa ja kehittämään toistettavia työnkulkuja tieteelliseen tutkimukseen R:ssä.

Challenge: Biologiset Muuttujat ja Vektorit

Ratkaisu