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Apprendre Challenge: Partage et Collaboration | Analyse Reproductible et de Type Génomique
R pour les Biologistes et la Bioinformatique
Section 4. Chapitre 6
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Challenge: Partage et Collaboration

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Tâche

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Organiser un projet R, exporter les résultats d'analyse et préparer les fichiers pour le partage avec des collaborateurs.

  • Création de répertoires pour les données, les résultats, les scripts et les figures.
  • Enregistrement d'une trame de données exemple au format CSV dans le répertoire data.
  • Réalisation d'une analyse simple sur les données et sauvegarde des résultats au format CSV dans le répertoire results.
  • Enregistrement d'un script R dans le répertoire scripts permettant de reproduire l'analyse.
  • Création d'un fichier README dans le répertoire principal du projet décrivant le projet et sa structure.
  • Liste de tous les fichiers du projet afin de confirmer leur préparation pour le partage.

Solution

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