
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("df1 has correct structure and at least 5 rows", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df1"), info = "df1 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df1), info = "df1 must be a data frame.")
  expect_true(all(c("SampleID", "Treatment", "Outcome") %in% colnames(df1)), info = "df1 must have columns 'SampleID', 'Treatment', and 'Outcome'.")
  expect_true(nrow(df1) >= 5, info = "df1 must have at least five rows.")
})

test_that("df2 filters only DrugA treatments", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df2"), info = "df2 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df2), info = "df2 must be a data frame.")
  expect_true(all(df2$Treatment == "DrugA"), info = "All rows in df2 must have Treatment as 'DrugA'.")
})

test_that("df3 filters only Alive outcomes", {
  organize_experiment_data()
  expect_true(exists("df3"), info = "df3 must exist in the global environment.")
  expect_true(is.data.frame(df3), info = "df3 must be a data frame.")
  expect_true(all(df3$Outcome == "Alive"), info = "All rows in df3 must have Outcome as 'Alive'.")
})

test_that("function does not require user input", {
  expect_error(organize_experiment_data(), NA, info = "The function should not require user input and should run without errors.")
})

test_main.R

Une introduction pratique à la programmation R conçue pour les biologistes et les bioinformaticiens. Apprenez à analyser, visualiser et interpréter des données biologiques avec R, à l'aide d'exemples concrets issus de la génomique, de l'écologie et de la biologie expérimentale.

Apprenez les bases de la programmation R avec un accent sur les données biologiques, y compris les variables, les types de données et la manipulation de données de base.

Plongez dans les méthodes statistiques pour analyser des données biologiques, y compris les statistiques descriptives, les tests d'hypothèses et l'interprétation des résultats.

Maîtriser l'art de la visualisation des données biologiques avec R, des graphiques de base aux visualisations avancées pertinentes pour les expériences.

Apprenez à travailler avec des données de type génomique et à développer des flux de travail reproductibles pour la recherche scientifique avec R.

Challenge: Organiser des Données Expérimentales

Solution