Det første steget i å gjennomføre en t-test er å formulere hypotesen. Disse hypotesene er antakelser som vi skal bekrefte eller avkrefte. To hypoteser er nødvendige: nullhypotesen og alternativhypotesen.

For en t-test sier nullhypotesen: "Gjennomsnittene til de to utvalgene er like." Alternativhypotesen, derimot, sier: "Gjennomsnittene til de to utvalgene er ikke like."

Nullhypotesen betegnes som H₀, og alternativhypotesen betegnes som Hₐ.

Hvis man på bakgrunn av t-testen forkaster nullhypotesen, aksepteres alternativhypotesen automatisk.

En annen måte å formulere en alternativ hypotese på er som følger:

Den sistnevnte formen brukes når:

1. Du er sikker på at én gruppe har enten et høyere eller lavere gjennomsnitt, men ikke motsatt. Dette gjelder for eksempel vårt eksempel med høyder, hvor vi trygt kan si at kvinner i gjennomsnitt ikke er høyere enn menn;

2. Du kun er interessert i å finne ut om noe er bedre. Hvis det ikke er bedre, spiller det ingen rolle om det er det samme eller verre. Dette ligner på et nytt nettsidedesign. Du ønsker kun å implementere det hvis det er en forbedring sammenlignet med det nåværende. Hvis det ikke er det, beholder du det nåværende designet til det nye er forbedret.