Det första steget i att genomföra ett t-test är att formulera hypotesen. Dessa hypoteser är de antaganden som vi kommer att bekräfta eller förkasta. Två hypoteser krävs: nollhypotesen och alternativhypotesen.

För ett t-test anger nollhypotesen: "Medelvärdena för två stickprov är lika." Alternativhypotesen, däremot, anger: "Medelvärdena för två stickprov är inte lika."

Nollhypotesen betecknas som $H_0$ och alternativhypotesen betecknas som $H_a$.

Om nollhypotesen förkastas baserat på t-testet accepteras alternativhypotesen automatiskt.

Ett annat sätt att formulera en alternativhypotes är enligt följande:

Den senare formen används när:

1. Du är säker på att en grupp har antingen ett högre eller lägre medelvärde, men inte tvärtom. Detta gäller i vårt exempel med längder, där vi med säkerhet kan säga att kvinnor i genomsnitt inte är längre än män;
2. Du är enbart intresserad av att avgöra om något är bättre. Om det inte är bättre, spelar det ingen roll om det är samma eller sämre. Detta liknar en ny webbdesign. Du vill bara införa den om den är en förbättring jämfört med den nuvarande. Om den inte är det, behåller du den nuvarande designen tills den nya har förbättrats.