
library(testthat)

source("user_code.R")
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("data directory contains sample data CSV", {
  expect_true(file.exists("data/sample_data.csv"),
    info = "sample_data.csv should exist in data directory")
})

test_that("results directory contains analysis results CSV", {
  expect_true(file.exists("results/analysis_results.csv"),
    info = "analysis_results.csv should exist in results directory")
})

test_that("scripts directory contains R analysis script", {
  expect_true(file.exists("scripts/analysis_script.R"),
    info = "analysis_script.R should exist in scripts directory")
})

test_that("main directory contains README file", {
  expect_true(file.exists("README.txt"),
    info = "README.txt should exist in main directory")
})

test_that("project_files includes all created directories and files", {
  out_user_code <- capture.output(source("user_code.R"))
  expect_true(any(grepl("data/sample_data.csv", out_user_code)),
    info = "data/sample_data.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("results/analysis_results.csv", out_user_code)),
    info = "results/analysis_results.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("scripts/analysis_script.R", out_user_code)),
    info = "scripts/analysis_script.R should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("README.txt", out_user_code)),
    info = "README.txt should be listed in project_files")
})

test_main.R

En praktisk introduktion till R-programmering anpassad för biologer och bioinformatiker. Lär dig att analysera, visualisera och tolka biologiska data med R, med verkliga exempel från genomik, ekologi och experimentell biologi.

Lär dig grunderna i R-programmering med fokus på biologiska data, inklusive variabler, datatyper och grundläggande datamanipulation.

Fördjupa dig i statistiska metoder för att analysera biologiska data, inklusive sammanfattande statistik, hypotesprövning och tolkning av resultat.

Bemästra konsten att visualisera biologiska data med hjälp av R, från grundläggande diagram till mer avancerade visualiseringar relevanta för experiment.

Lär dig att arbeta med genomikliknande data och utveckla reproducerbara arbetsflöden för vetenskaplig forskning i R.

Challenge: Sharing and Collaboration

Lösning