Notice: This page requires JavaScript to function properly.
Please enable JavaScript in your browser settings or update your browser.
Lära Challenge: Manipulating Genomic Data | Reproducible and Genomic-Style Analysis
R for Biologists and Bioinformatics

bookChallenge: Manipulating Genomic Data

Uppgift

Swipe to start coding

Write a function that takes a gene expression matrix, a vector of gene names, and a vector of sample names, and returns both the subsetted matrix and a vector of average expression values for each selected gene across the selected samples.

  • Subset the input matrix to include only the specified genes (rows) and samples (columns).
  • Calculate the average expression value for each selected gene across the selected samples.
  • Return a list containing the subsetted matrix and the vector of average expression values.

Lösning

Var allt tydligt?

Hur kan vi förbättra det?

Tack för dina kommentarer!

Avsnitt 4. Kapitel 2
single

single

Fråga AI

expand

Fråga AI

ChatGPT

Fråga vad du vill eller prova någon av de föreslagna frågorna för att starta vårt samtal

Suggested prompts:

Can you explain this in simpler terms?

What are the main points I should remember?

Can you give me an example?

close

bookChallenge: Manipulating Genomic Data

Svep för att visa menyn

Uppgift

Swipe to start coding

Write a function that takes a gene expression matrix, a vector of gene names, and a vector of sample names, and returns both the subsetted matrix and a vector of average expression values for each selected gene across the selected samples.

  • Subset the input matrix to include only the specified genes (rows) and samples (columns).
  • Calculate the average expression value for each selected gene across the selected samples.
  • Return a list containing the subsetted matrix and the vector of average expression values.

Lösning

Switch to desktopByt till skrivbordet för praktisk övningFortsätt där du är med ett av alternativen nedan
Var allt tydligt?

Hur kan vi förbättra det?

Tack för dina kommentarer!

Avsnitt 4. Kapitel 2
single

single

some-alt