
library(testthat)

source("user_code.R")
library(testthat)

source("user_code.R")
test_that("data directory contains sample data CSV", {
  expect_true(file.exists("data/sample_data.csv"),
    info = "sample_data.csv should exist in data directory")
})

test_that("results directory contains analysis results CSV", {
  expect_true(file.exists("results/analysis_results.csv"),
    info = "analysis_results.csv should exist in results directory")
})

test_that("scripts directory contains R analysis script", {
  expect_true(file.exists("scripts/analysis_script.R"),
    info = "analysis_script.R should exist in scripts directory")
})

test_that("main directory contains README file", {
  expect_true(file.exists("README.txt"),
    info = "README.txt should exist in main directory")
})

test_that("project_files includes all created directories and files", {
  out_user_code <- capture.output(source("user_code.R"))
  expect_true(any(grepl("data/sample_data.csv", out_user_code)),
    info = "data/sample_data.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("results/analysis_results.csv", out_user_code)),
    info = "results/analysis_results.csv should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("scripts/analysis_script.R", out_user_code)),
    info = "scripts/analysis_script.R should be listed in project_files")
  expect_true(any(grepl("README.txt", out_user_code)),
    info = "README.txt should be listed in project_files")
})

test_main.R

Практичний вступ до програмування на R, розроблений для біологів та біоінформатиків. Вивчення аналізу, візуалізації та інтерпретації біологічних даних за допомогою R з використанням реальних прикладів з геноміки, екології та експериментальної біології.

Вивчення основ програмування на R з акцентом на біологічні дані, включаючи змінні, типи даних та базову обробку даних.

Занурення у статистичні методи аналізу біологічних даних, включаючи описову статистику, перевірку гіпотез та інтерпретацію результатів.

Оволодіння мистецтвом візуалізації біологічних даних за допомогою R: від базових графіків до більш складних візуалізацій, актуальних для експериментів.

Вивчення роботи з даними у геномному стилі та розробка відтворюваних робочих процесів для наукових досліджень у R.

Challenge: Sharing and Collaboration

Рішення